假如沒有翁啟惠，台灣的生物科技產業不會長成今天這個樣子」，是很多人的共識。翁啟惠自擔任中研院基因體中心主任，鼓勵技轉及產業化，並延攬國內外人才，共同推動《生技產業條例》，成為台灣生技業的重要推手。
「台灣生技業現在有20幾個藥走到三期臨床，拿到藥證後就是量產、銷售。一定有好幾個會成功，所以期待是有它的道理。你說會落空？我不相信。」翁啟惠樂觀看待台灣生技產業，但他強調，問題是這些產品真的有市場嗎？價值有多高？能不能在國際市場占有一席之地？假如有，只要1、2個藥成功，就能奠定台灣生技產業的基礎。
他認為，全世界能發展高階生技的國家不到10個，而且都是在教育、創新上非常完整的先進國家，只要台灣有1、2個藥成功，就能證明台灣生技可從頭走到尾。他也指出，生技產業之所以有前景，因為華人占了全世界4分之1人口，但使用的醫藥或健康產品都是西方世界研發出來的。基因不一樣、生活習慣不一樣、對健康的概念也不一樣，甚至醫藥的使用劑量都不一樣；光是照顧這四分之一的人口，就有相當大的市場，更何況拓展到不同人種。
「台灣在生技的研究很有活力，我只是當啦啦隊。假如政府看得到，應該去培植，不是只停留在學術界」。怎麼樣讓學術跟產業銜接，與國家發展目標一致，要靠政策引導；翁啟惠認為，台灣生技業素質高，會超越新加坡、南韓、日本。
他解釋，新加坡雖然很敢延攬人才，只是製造了一個平台，並沒有深耕。南韓政府拚大企業模式，但生技業的特色在於變化太大，不能走大企業；美國重要的藥都是小公司發明出來的，台灣中小企業是有名的，很適合發展；日本走傳統製藥較保守，台灣更顯創新，「台灣的活力看來看去是最強的，就是要有環境和制度支持，少批評，多鼓勵，就能成功。」
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